不同物种snR72~snR78的比较基因组分析

摘要 : 采用生物信息学技术对不同物种 snR72~snR78 (snR72、snR73、snR74、snR75 、snR76、snR77和snR78) snoRNA基因进行了比较基因组学研究。结果发现， 真菌中snR72~snR78具有较高的保守性， 它们串联在一起形成基因簇。但在真菌的不同种中， 基因簇中的部分snoRNA发生了缺失、位移和重组。动物和植物均存在着真菌 snR72~snR78基因的同源分子。但是， 与真菌snR72~snR78基因簇不同， 动物和植物中的真菌snR72~snR78基因的同源分子并不是串联在一起形成基因簇， 而是分散在基因组的不同位点。目前， 在动物中尚未发现snR72和snR75， 在植物中尚未发现snR76。值得注意的是， 在真菌中， snR72~snR78基因簇的各成员只有一个拷贝， 但在人、动物和植物中， snR72~snR78 的一些成员有多个拷贝。人和小鼠的snR73和snR76 有多个拷贝， 拟南芥snR72、snR75、snR77和 snR78有多个拷贝， 水稻snR73、snR75和snR77有多个拷贝。而且， 一些多拷贝的snoRNA基因串联在一起， 表明动植物中的这些多拷贝的基因很可能是在进化过程中由局部复制产生。