通过基于iTRAQ的蛋白组学方法筛选与TGF-β1调控瓣膜间质细胞活化相关的关键蛋白
由万宁1 金炼驰1 赖永洁2*
（1遵义医科大学珠海校区/贵州省免疫学研究生创新研究基地, 珠海 519041; 2遵义医科大学珠海校区免疫学与病原生物学教研室, 珠海 519041)
摘要 :
瓣膜间质细胞(valve interstitial cells, VICs)由成纤维细胞表型分化为肌成纤维细胞表 型, 即VICs活化是驱动瓣膜纤维化病变的早期关键环节, 而转化生长因子-β1(transforming growth factor-β1, TGF-β1)是诱导VICs活化的经典细胞因子, 该文利用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ) 技术对TGF-β1处理前后的VICs进行了差异蛋白质组学分析, 以期发现与VICs活化相关的关键蛋 白。该研究以原代培养的大鼠VICs为对象, 利用蛋白组学方法分析TGF-β1处理VICs前后蛋白质表 达谱的变化, 通过多种生物学信息分析方法对重点差异蛋白进行筛选, 并利用qRT-PCR与Western blot法验证候选蛋白的表达差异。结果显示, 共鉴定出可定量差异蛋白7 104个, 其中包括具有显著 差异(P<0.05)的上调蛋白404个、下调蛋白494个。GO分析显示差异蛋白主要富集到多细胞生物学 过程、DNA结合功能以及细胞外基质区域组分等功能条目中, KEGG分析显示差异蛋白主要参与 DNA复制、错配修复及黏着斑等信号通路。此外, 进一步发掘出了AKAP12、FBLN2、NCAM1、 MFAP4以及CADM4等5种与VICs活化相关的新型候选蛋白。该研究全面解析了TGF-β1处理前后 的VICs差异蛋白表达谱, 为进一步阐明VICs活化与瓣膜性心脏病的发生机制提供了新的线索。
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