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白菜EST-SSR标记的通用性


忻 雅1,2 崔海瑞1* 张明龙1 姚艳玲1 卢美贞1 金基强1 林容杓3 崔水莲3
1浙江大学原子核农业科学研究所,杭州 310029;2杭州市农业科学研究院生物所,杭州 310024;3忠南大学园艺系,大田305764,韩国
摘要 : EST-SSR是从表达序列标签(expressed sequence tag, EST)中开发的新型简单序列重复(simple sequence repeat, SSR)标记。根据白菜EST设计了15对SSR引物,对白菜、油菜、玉米、高粱、水稻和茶树等进行了PCR,研究了白菜的EST-SSR标记在不同物种间的通用性。所设计的引物对不同白菜品种、近缘种油菜和远缘种玉米、高粱、水稻和茶树的扩增成功率分别为100%、93.3%、80%、93.3%、93.3%和86.7%。在15对引物中,有11对在远缘种中都有扩增产物,而且一些引物可显示多态性,多态性引物分别占了可扩增引物的33.3%、28.6%、28.6%和61.5%。这些结果表明,白菜EST-SSR引物具有较高的通用性,这对于比较基因组学研究有重要意义。