毛竹LTR反转录转座子PHRE6的克隆与转录活性分析
张赞一1,2 周明兵1,2* 汤定钦1,2
1浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室, 杭州 311300; 2浙江省竹资源与高效利用协同创新中心, 浙江农林大学, 杭州 311300
摘要 : 长末端重复序列(long terminal repeat, LTR)反转录转座子是真核生物基因组中普 遍存在的一类可移动的DNA序列, 因两端具有长末端重复序列而得名。大多数LTR反转录转座 子能够感受外界环境的变化, 具有转录激活特性和转座激活特性。该研究从毛竹(Phyllostachys edulis, Ph. edulis)基因组中克隆出一条完整的LTR反转录转座子, 命名为PHRE6(Phyllostachys edulis retrotransposons 6), 该转座子全长为5 620 bp, 具有GAG和POL保守结构域。通过荧光定量PCR检测 了PHRE6在DNA甲基化抑制剂和不同胁迫处理(包括辐照、高温、低温、高盐)的毛竹实生苗中转 录水平的变化, 结果表明, 在DNA甲基化抑制剂处理后和高温(42 °C)、低温(16°C、4 °C)、高盐(100 mmol/L、 200 mmol/L、300 mmol/L NaCl溶液)胁迫处理下PHRE6表达水平均有显著提高。以上结果说明, PHRE6是一个具有转录活性的反转录转座子, 可能参与毛竹逆境响应过程。
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