REV感染DF-1细胞分泌外体的生物信息学分析

王小满^1,2# 庄萍萍^1# 孙霞³ 杜旭升¹ 王晓宇¹ 成子强^1,2 王桂花^1,2*

¹山东农业大学动物科技学院, 泰安 271018; ²山东省动物生物功能与疾病防治重点实验室, 泰安 271018; ³山东畜牧兽医职业学院, 潍坊 261061

摘要 : 该研究探讨了REV感染DF-1细胞分泌外体携带表达差异的蛋白质和微RNA(microRNA, miRNA), 及其基因功能和参与的信号通路, 为病毒致病机制研究提供了基础。通过蛋白组学和转录组学检测技术, 筛选病毒感染组与对照组DF-1细胞分泌外体的差异蛋白质和miRNA,并利用在线软件数据库对其进行GO功能富集和KEGG信号通路分析。结果筛选到101个差异表达蛋白质, 其中56个表达上调, 45个表达下调, 共参与155条信号通路, 参与蛋白质最多的是肿瘤相关通路; 并筛选到3个表达上调的miRNA, 其中miRNA-155、miRNA-146a-3p编码的靶蛋白(整合蛋白)与差异蛋白质肌动蛋白相关2/3复合体(actinrelated 2/3 complexs, Arp2/3)共同参与肌动蛋白细胞骨架信号通路; 差异蛋白质及miRNA编码靶基因均含有病毒成分, 并参与细胞信号转导、免疫、黏附、运动、生物调节等过程。该研究结果表明, REV感染DF-1细胞来源外体表达差异的蛋白质和miRNA及其参与的生物学过程和信号通路与肿瘤形成密切相关, 外体途径可能在REV致瘤机制中具有重要作用。