花粉发育相关基因BjMF6的分子克隆及其生物信息学分析

摘要 : 根据白菜花粉特异的多聚半乳糖醛酸酶(PG)基因BcMF6的全长序列设计引物， 通过PCR直接扩增的方法从茎瘤芥(Brassica juncea Czern. et Coss var. tumida Tsen et Lee)‘浙桐1号’和分蘖芥(Brassica juncea var. multiceps Tsen et Lee)‘雪里蕻’中克隆到了BcMF6的同源基因BjMF6t和BjMF6m。BjMF6t和BjMF6m的序列完全相同， 故合称BjMF6。该基因与BcMF6在DNA水平的相似性高达99.6%。Blast分析发现它与拟南芥外切PG基因在氨基酸水平上有很高的相似性， 并且具有所有PG基因特有的功能结构域和活性位点， 推测BjMF6属于PG基因。通过序列分析和系统树构建进一步证明了该基因可能是与花粉发育相关的PG基因。