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一种有效纯化低拷贝质粒DNA的改良硅藻土法


余宏傲 张岚岚 徐昌杰*
浙江大学园艺系,农业部园艺植物生长发育与生物技术重点开放实验室, 杭州310029
摘要 : 碱法制备的低拷贝质粒因含有大量杂质而无法获得有效的测序结果。为此,以纯 lDNA为样品,对硅藻土纯化DNA的方法进行了优化,表明硅藻土悬液的最佳用量是20 ml/mg lDNA,回收率达77.31%。应用此改良硅藻土法纯化一长为14 953 bp的低拷贝质粒pLZ14,所得质粒纯度达23.87%,比未纯化前提高了11.06倍。经纯化的pLZ14质粒测序信号强、无误认碱基,而未经纯化的质粒测序时信号弱、错误普遍存在。