NaIO4氧化–深度测序技术的优化用于检测微量RNA样品中小RNA 3′末端甲基化修饰

2′-O-甲基化是存在于多种小RNA 3′末端的修饰, 具有重要的生物学功能。目前高通量研究小RNA 3′末端2′-O-甲基化的方法主要是NaIO4氧化处理结合小RNA深度测序, 但该方法需要3 μg总RNA, 难以用于研究少量细胞中小RNA的3′末端甲基化修饰。该研究通过调整NaIO4氧化处理的条件以及测试有无甘油终止氧化反应对小RNA文库构建的影响, 优化了适用于微量RNA的氧化条件, 实现对10 ng小鼠睾丸样本总RNA中的小RNA 3′末端甲基化修饰的深度测序检测, 建立了用于检测微量RNA样品中小RNA 3′末端甲基化修饰的方法, 为检测少量细胞中小RNA的3′末端甲基化修饰提供了有效方法。