小鼠新基因克隆及功能预测

摘要 : 该研究克隆了一个可能与小鼠核酸结合相关的新基因, 并对其表达模式和预期编码蛋白质功能进行了预测分析。该研究采用启动子捕获技术获得了具有启动子活性的基因组片段, 结合生物信息学方法预测得到该启动子活性片段下游基因。采用RT-PCR(reverse transcription PCR)技术扩增得到相应基因, 其cDNA为1 504 bp, 完整开放阅读框(open reading frame, ORF)为540 bp,编码179个氨基酸。同源性分析表明, 该基因与褐鼠(Rattus norvegicus)核酸结合蛋白和黑猩猩(Pantroglodytes)RNA结合蛋白的基因序列分别有78%和40%的相似性。利用实时荧光定量PCR技术分析了不同组织和不同生理、病理状态下该基因的表达水平。结果表明, 该基因在带瘤小鼠各组织中的表达水平均高于健康小鼠相应组织, 提示该基因可能参与了肿瘤的发生、发展。