ITm活性转座子及其结构特征分析

摘要 : ITm超家族是真核生物基因组中分布最广泛的DNA转座子家族之一, 它们以DNA为媒介, 通过“剪切–粘贴”机制在基因组中不断跳跃, 引起基因组的重组与突变。随着对ITm转座子的深入研究, 许多ITm转座子逐渐成为基因克隆、基因表达及其功能研究的重要工具。该文对活性ITm转座子作了较为全面的研究, 并对其结构、拷贝数、分布以及转座特性进行了系统归纳, 分析了活性ITm转座子螺旋–转角–螺旋(helix-turn-helix, HTH)结构, 天冬氨酸–天冬氨酸–天冬氨酸/谷氨酸(Asp-Asp-Asp/Glu, DDD/E)催化结构域、Linker、核定位信号(nuclear localization sequence, NLS)及末端反向重复序列(terminal inverted repeats, TIRs)的序列特征。结果表明, 自主转座活性的ITm转座子必须具备完整的转座酶及TIRs, 上述结构及序列的突变均会不同程度的对转座子活性产生影响。这为活性ITm转座子的鉴定及功能分析奠定了重要基础, 同时, 也为人工调控ITm转座子转座活性提供了理论依据。