红花(Carthamus tinctorius L.)不同开花时期的转录组测序及黄酮合成相关基因的验证

刘秀明^1,2 张宇² 姚娜¹ 崔喜燕¹ 王立勇¹ 董园园¹ 王南¹ 李晓薇^1,2 李海燕^1,2* 李校堃^1*

¹吉林农业大学生物反应器与药物开发教育部工程研究中心, 长春 130118;
²吉林农业大学生命科学学院, 长春 130118

摘要 : 应用454测序技术对红花(Carthamus tinctorius L.)初花期和盛花期两个样本进行转录组测序, 分别获得了577 664和562 930条Clean reads片段, 其平均长度分别为427 bp和436 bp。差异表达分析结果发现, 在初花期获得40 139个基因, 盛花期获得39 768个基因, 在两个时期同时表达的基因有28 316个。COG/KOG分析中, 获得了大量与代谢相关的功能注释信息, 注释到比例最高的为功能预测, 占24.681%。KEGG Pathway富集分析中, 找到红花黄酮化合物合成途径中的关键酶基因, 利用Real-time PCR方法验证了三个基因的正确性。表达量分析表明, 查尔酮合酶在两个红花品种中各个开花时期的相对表达量最高。