乳腺癌特异性拷贝数变异致DNA修复失衡

高猛¹ 程竹君² 张成¹ 熊招平² 廖尉廷² 邓立彬^1,2 卢曲琴^1*

¹南昌大学医学部, 南昌 330006; ²南昌大学转化医学研究院, 南昌 330006

摘要 : 该研究通过整合4个功能诠释数据库(KEGG、GO、WIKI和PC)共发现56条DNA修复相关通路, 确定了725个功能基因; 并在筛查CCLE肿瘤细胞系和TCGA乳腺癌基因组数据的基础上,
发现了89个乳腺癌特异性的拷贝数变异基因, 其中包含了4个DNA修复相关的基因[BRCA1(breast cancer 1, early onset)、ERBB2(erb-b2 receptor tyrosine kinase 2)、G6PC(glucose-6-phosphatase, catalytic subunit)和PSME3(proteasome (prosome, macropain) activator subunit 3 (PA28 gamma; Ki))]。进一步生物信息分析表明, 乳腺癌基因组中17q21.31区域的拷贝数变异可通过改变BRCA1和PSME3基因的表达, 从而影响DNA修复功能(如双链的断裂修复和DNA损伤相关检测点)。