利用环形染色体构象捕获技术对Bcl11b基因座位在细胞核内空间组织的研究

摘要 : 环形染色体构象捕获(4C)技术实现了在全基因组范围内捕获与4C靶位点发生相互作用的基因座位, 因而通过4C相关技术可以进一步研究靶基因座位在细胞核内的空间组织形式。该文以Bcl11b基因座位作为4C分析的靶位点, 通过优化4C分析的反向巢式PCR扩增条件, 实现4C分析PCR的高效扩增; 并通过有限克隆筛选与普通测序分析相结合的方法, 在全基因组范围内捕获到一些与Bcl11b基因座位发生潜在相互作用的基因座位。这些基因座位与靶位点间的相互作用既有发生在相同染色体内的, 也有发生在不同染色体之间的。这些基因座位间的相互作用表明了Bcl11b基因座位在细胞核内复杂的空间组织形式。